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核酸染色劑對DNA在瓊脂糖凝膠電泳中遷移速度的影響

薄秀梅 徐州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院國家級基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實驗教學(xué)示范中心; 江蘇徐州221004

關(guān)鍵詞:eb gelred 遷移速度 瓊脂糖凝膠電泳 

摘要:核酸染色應(yīng)用在許多DNA檢測相關(guān)的技術(shù)領(lǐng)域,然而染色劑結(jié)合DNA會造成電泳遲滯。為研究溴化乙錠(ethidium bromide,EB)和GelRed這2種核酸染色劑對DNA在瓊脂糖凝膠電泳中遷移速度的影響,分別用這2種染色劑采用前、后染色的方法對DNA進(jìn)行染色,以瓊脂糖凝膠電泳作為檢測方法,凝膠成像系統(tǒng)拍照觀察,用Reptation理論分析數(shù)據(jù)。研究結(jié)果表明EB和GelRed染色均使DNA遷移發(fā)生了滯后,但EB對于目的基因片段大小的判讀未受電泳滯后的影響,而GelRed對目的基因判讀略有影響。然而,與EB相比,GelRed具有熒光效果強、安全、環(huán)保等諸多優(yōu)點。總之,需要精確鑒定目的基因片段大小可以選擇后染色或EB前染色,對于鑒定目的基因片段大小要求不高且需要熒光效果好、環(huán)保的染色劑可以選擇GelRed。

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