關鍵詞:克隆 基因 綿羊
摘要:旨在克隆IGFBP-3基因的CDS序列及其生物信息學分析,試驗以涼山半細毛羊為研究對象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-3基因的CDS全序列,生物信息學方法深入分析其序列。結果表明:IGFBP-3基因的CDS序列為882bp,編碼293個氨基酸,與牛、人、鼠的CDS同源性分別為94%、83%、81%,氨基酸序列同源性分別為91%、77%、79%,GenBank登錄號為FJ752574;IGFBP-3基因的氨基酸分子量為31.5KD,理論等電點(pI)為8.98;進化分析顯示與牛、山羊等哺乳動物關系較近,與雞、魚類等親緣關系較遠;IGFBP-3基因存在明顯的疏水性區(qū)域和親水性區(qū)域,有一個信號肽、25個磷酸化位點、7個N-糖基化位點和4個O-糖基化位點;二級結構分析顯示無規(guī)卷曲、α-螺旋和β-折疊區(qū)域分別為73.04%、13.99%、12.97%;三級結構分析顯示存在IGFBP—N和甲狀腺球蛋白-Ⅰ型功能域。為進一步研究綿羊IGFBP一3基因的功能奠定基礎。
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