金烏賊微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)及兩個野生群體遺傳多樣性比較
關(guān)鍵詞：金烏賊 微衛(wèi)星標(biāo)記 野生群體 遺傳多樣性
摘要：為進(jìn)一步了解金烏賊Sepia esculenta野生群體遺傳多樣性水平,采用磁珠富集法從金烏賊基因組中開發(fā)了微衛(wèi)星標(biāo)記,并應(yīng)用青島(QD)金烏賊野生群體對其多態(tài)性進(jìn)行評價,進(jìn)而比較了青島和長江口(CJK)兩個野生群體的遺傳差異。結(jié)果表明:開發(fā)標(biāo)記的種群遺傳學(xué)評價顯示,在269個克隆子中,有192個含有微衛(wèi)星序列(71.38%),基于該序列設(shè)計(jì)85對引物,其中20對通過篩選,完美型占60%,非完美型占10%,復(fù)合型占30%;經(jīng)群體驗(yàn)證,表觀等位基因數(shù)(A)為2~17不等,平均為8.15,觀測雜合度(HO)分布范圍為0.146~0.936,平均為0.630,期望雜合度(HE)分布范圍為0.172~0.930,平均為0.702;其中5個位點(diǎn)不符合哈迪-溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡預(yù)期,存在零等位基因可能是其偏離平衡的原因;應(yīng)用本研究開發(fā)的引物對2個近源種擴(kuò)增,開發(fā)的20個標(biāo)記位點(diǎn)中有6個在針烏賊Sepia andreana中表現(xiàn)為多態(tài),4個位點(diǎn)在曼氏無針烏賊Sepiella maindroni中表現(xiàn)為多態(tài);應(yīng)用開發(fā)的11個位點(diǎn)對青島和長江口兩個野生群體進(jìn)行遺傳差異分析顯示,所有位點(diǎn)中,青島群體共檢測到163個等位基因,長江口群體共檢測到152個等位基因,每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)為5~28和6~26不等,平均等位基因數(shù)分別為14.818和13.818;青島群體獨(dú)有等位基因19個,觀測雜合度分布范圍為0.250~0.936,平均為0.731,期望雜合度分布范圍為0.265~0.930,平均為0.771,多態(tài)信息含量為0.223~0.946,平均為0.746;長江口群體獨(dú)有等位基因8個,觀測雜合度分布范圍為0.500~0.896,平均為0.731,期望雜合度分布范圍為0.623~0.960,平均為0.857,多態(tài)信息含量為0.614~0.948,平均為0.845;群體間遺傳分化較弱(Fst值為0.032 5),群體分配分析結(jié)果表明,兩個種群中所有個體正確分配到各自種群的概率分別為86.4%和84.0%。研究表明,本試驗(yàn)中開發(fā)的微衛(wèi)星標(biāo)記位點(diǎn)多樣性水平略低于前人的研究,但有一定的跨種擴(kuò)增通用性,長江口群體多樣性?
大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào)雜志要求:
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