竹?魚微衛星標記開發及跨物種擴增
關鍵詞：微衛星標記 跨物種擴增
摘要：【目的】篩選高多態性竹?魚(Trachurus japonicus)微衛星(SSR)標記,并驗證其在鲹科魚類中的通用性。【方法】采用SLAF-seq技術識別竹?魚基因組SSR標記,利用聚丙烯酰胺凝膠電泳和毛細管電泳篩選高多態性位點,并進行跨物種PCR擴增。【結果與結論】識別出43264個二至六堿基重復SSR標記,二、三堿基重復SSR標記較多(90.33%)。篩選出37個多態性的二、三堿基SSR位點,各位點的等位基因數為4~26,期望雜合度為0.481~0.935,多態信息含量為0.440~0.934。有30個位點符合哈迪-溫伯格平衡,且各位點間不存在連鎖不平衡現象。共有28個竹.魚SSR標記可在1種以上鲹科魚類中有效擴增,分別有24、21、20、19和11個SSR位點可在藍圓鲹(Decapterus maruadsi)、長身圓鲹(Decapterus macrosoma)、無斑圓鲹(Decapterus kurroides)、頜圓鲹(Decapterus macarellus)及金帶細鲹(Selaroides leptolepis)中穩定擴增,可為竹?魚遺傳資源評估和部分鲹科魚類的系統進化分析提供重要遺傳物質基礎及有力的分析手段。
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