玉米大斑病菌轉(zhuǎn)錄因子StMSN4基因的克隆及表達模式分析
關鍵詞：玉米大斑病菌 msn4 基因結(jié)構(gòu)
摘要：為明確玉米大斑病菌轉(zhuǎn)錄因子StMSN4基因的結(jié)構(gòu)特征及其在病菌重要生長發(fā)育時期的表達模式,本試驗以釀酒酵母ScMSN4氨基酸序列為探針,在玉米大斑病菌基因組數(shù)據(jù)庫中搜索并克隆其同源基因,并對該基因的結(jié)構(gòu)及其編碼蛋白的理化性質(zhì)、空間結(jié)構(gòu)等進行預測;通過分析病菌關鍵生長發(fā)育階段的RNA-Seq數(shù)據(jù),明確該基因的表達模式。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在玉米大斑病菌基因組中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,將其命名為StMSN4;該基因DNA全長為1357 bp,cDNA全長為1296 bp,包含2個外顯子,1個內(nèi)含子;其編碼蛋白包含431個氨基酸,含有2個典型ZnF-C2H2保守結(jié)構(gòu)域。通過對病菌的菌絲、分生孢子、芽管、附著胞和侵入釘時等5個典型發(fā)育時期的RNA-Seq數(shù)據(jù)分析表明,StMSN4基因在5個發(fā)育時期均有表達,且表達水平較高,表明該基因在病菌的生長發(fā)育階段發(fā)揮著重要的作用。本研究不僅明確了StMSN4基因的結(jié)構(gòu)特性及其表達模式,也為深入研究該基因的功能及HOG-MAPK信號轉(zhuǎn)導途徑的作用機制奠定了基礎。
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