結核分枝桿菌RodA蛋白結構特征的生物信息學分析
鄭輝; 王華林; 李娜; 張露; 周放; 余曉麗; 劉 武漢輕工大學生物與制藥工程學院; 湖北武漢430023; 武漢市醫療救助中心; 湖北武漢430023
關鍵詞：結核分枝桿菌 roda 蛋白結構 抗原性
摘要：運用生物信息學軟件分析及預測結核分枝桿菌Rv0017c基因編碼蛋白RodA的結構與功能。采用NCBI、ExPASY、PSORTb等在線工具分析結核分枝桿菌Rv0017c的基因信息,分析其保守域、理化性質和亞細胞定位;利用SOPMA、Vaxijen v2.0等軟件預測RodA蛋白的二、三級結構和抗原性。結果表明:Rv0017c基因全長1 410 bp,編碼469個氨基酸,分子量為50 610.83,蛋白序列具有高度的保守性。RodA的二級結構中,α螺旋所占比例最多,其次是C無規卷曲結構,而β折疊相對占比很少。RodA并非MTB發揮毒力效應的蛋白因子,但具有較高的抗原性。結論為RodA蛋白序列保守穩定,在結核菌的膜壁形成中發揮巨大作用,且具有較高的抗原性,可作為治療耐藥結核的新靶標。
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