西太平洋浮游有孔蟲Globigerinita glutinata種內(nèi)SSU rDNA多樣性研究
關(guān)鍵詞：globigerinita glutinata 活體浮游有孔蟲 單細(xì)胞pcr 克隆技術(shù)
摘要：有孔蟲分子鑒定和分子多樣性研究多基于SSU rDNA序列片段分析,但某些浮游種內(nèi)可能存在基因組內(nèi)rDNA變化,影響分類學(xué)和分子生態(tài)學(xué)的研究結(jié)果。為了研究浮游有孔蟲物種內(nèi)是否存在rDNA多樣性,本工作以采自熱帶西太平洋的浮游有孔蟲Globigerinita glutinata活體標(biāo)本作為研究對象,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定后,利用單細(xì)胞PCR和克隆技術(shù),獲得5個蟲體的20條SSU rDNA目的片段(300—400 bp),同時對其序列結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。結(jié)果顯示,同種G.glutinata出現(xiàn)了四類不同的SSU rDNA核酸類型。序列成對分析顯示,該種遺傳距離差異最長可達(dá)0.249,遠(yuǎn)高于其它物種。此外,同一樣本不同克隆片段中,出現(xiàn)了高達(dá)四個不同的SSU rDNA核酸型。序列的差異主要集中在三個不同的高變異區(qū),高可變區(qū)的長度范圍為21 bp到63 bp。從差異序列的間隔分布推斷,核糖體基因簇的重組可能是不同SSU rDNA核酸型出現(xiàn)的原因。本工作在國內(nèi)首次揭示了熱帶西太平洋浮游有孔蟲G.glutinata種內(nèi)的SSU rD NA核酸型,研究結(jié)果表明G.glutinata的種內(nèi)SSU rDNA變異性極大,復(fù)雜的生活史以及假基因的存在或許是造成該現(xiàn)象的原因。
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