基于全基因組測序的蒙古馬運(yùn)動(dòng)相關(guān)的正向選擇基因篩選
關(guān)鍵詞：蒙古馬 運(yùn)動(dòng)性狀 全基因組測序 正向選擇
摘要：旨在從基因組水平對蒙古馬運(yùn)動(dòng)性狀涉及的相關(guān)基因進(jìn)行分析。本研究利用全基因組測序技術(shù),對蒙古馬的血液進(jìn)行采樣和基因組測序,并且結(jié)合人、牛、小鼠等7種哺乳動(dòng)物的基因組數(shù)據(jù),對蒙古馬的特有基因和正向選擇基因進(jìn)行篩選。分析數(shù)據(jù)得到已注釋的蛋白編碼基因19475種,并篩選出了38種蒙古馬特有基因和45種正向選擇基因。根據(jù)GO富集、KEGG通路富集分析和前人研究,發(fā)現(xiàn)包括MAPK13、CCN2、FSCN3、BTG1、TF等17種正向選擇的蛋白編碼基因可能參與蒙古馬的運(yùn)動(dòng)過程。這些運(yùn)動(dòng)相關(guān)正向選擇基因的生物學(xué)功能涉及到肌動(dòng)蛋白絲結(jié)構(gòu)、心肌收縮的正調(diào)節(jié)、鈣離子結(jié)合、調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)pH、血管生成、膠原生物合成過程的正調(diào)節(jié)等。而7種miRNAs(包括eca-miR-302c、eca-miR-8974、eca-miR-9077等)則通過與mRNA的3′UTR區(qū)域作用分別潛在靶向調(diào)控運(yùn)動(dòng)相關(guān)的MAPK13、LOC100057755、EHD4、MICAL3、TMBIM1和F11R。以上涉及的運(yùn)動(dòng)相關(guān)正向選擇的蛋白編碼基因可以促進(jìn)人們對于蒙古馬運(yùn)動(dòng)性狀的了解,并為靶向競技型的家畜育種提供分子理論基礎(chǔ)。
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