青海湖微生物群落的共生模式
關(guān)鍵詞：青海湖 細(xì)菌 古菌 高通量測(cè)序 環(huán)境因子
摘要：目的全面探究青海湖細(xì)菌和古菌的群落結(jié)構(gòu)、物種與環(huán)境因子的相關(guān)性及種群間的互作關(guān)系。方法利用高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)青海湖細(xì)菌(V3-V4區(qū))和古菌( V3-V5 區(qū))的16SrRNA 基因進(jìn)行測(cè)序,分析微生物群落組成;計(jì)算環(huán)境因子與物種間的Spearman 和Pearson 的相關(guān)系數(shù);基于網(wǎng)絡(luò)分析對(duì)樣本中細(xì)菌和古菌的共線性、物種間的相關(guān)性進(jìn)行分析。結(jié)果細(xì)菌群落歸屬33門(mén)66綱395屬,優(yōu)勢(shì)類(lèi)群為Proteobacteria(6053%)、Bacteroidetes(1739%)和Actinobacteria(1161%),優(yōu)勢(shì)種群依次為L(zhǎng)oktanella(1184%)、Nitrincola(678%)和Pseudarthrobacter( 3.72%);古菌群落歸屬12門(mén)19綱68屬,優(yōu)勢(shì)類(lèi)群為Euryarchaeota(4096%)、Woesearchaeota DHVEG-6(3444%)和Thaumarchaeota (2091%),優(yōu)勢(shì)種群依次為Woesearchaeota DHVEG-6 norank(3444%)、Methanosarcina(2405%)和Soil Crenarchaeotic Group norank(19.04%)。細(xì)菌優(yōu)勢(shì)種群Loktanella 及Nitrincola 的分布主要與總有機(jī)氮呈正相關(guān),古菌優(yōu)勢(shì)種群Methanosarcina、SCG norank及Methanosaeta 的分布主要與總鹽度及離子濃度( CO3^2-、SO4^2-、Cl^-、Ca^2+、Mg^2+、Na+和K+)呈正相關(guān)。細(xì)菌核心類(lèi)群Proteobacteria(如Arcobacter)、Bacteroidetes(如NS9 marine group norank)和Actinobacteria(如Microbacteriaceae norank)多以互利共生關(guān)系存在。在古菌核心類(lèi)群Euryarchaeota中,同甲烷代謝相關(guān)的甲烷微菌綱Methanomicrobia(如Methanosarcina)、甲烷桿菌綱Methanobacteria(如Methanobacterium)與嗜鹽古菌的鹽桿菌綱Halobacteria(如Halapricum)以競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系存在,而鹽桿菌綱屬成員及甲烷代謝相關(guān)菌屬的內(nèi)部彼此呈共生關(guān)系。結(jié)論青海湖微生物群落結(jié)構(gòu)復(fù)雜,物種受多種環(huán)境因子的影響,細(xì)菌種群多呈互利共生關(guān)系,同甲烷代謝相關(guān)的屬群與所屬鹽桿菌綱的種群多呈競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系。
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