甘藍(lán)型油菜及其二倍體祖先種COR413家族基因生物信息學(xué)分析
袁淑培; 張付貴; 黃倩; 程希; 高桂珍; 伍曉明 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所/農(nóng)業(yè)部油料作物生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 湖北武漢430062
關(guān)鍵詞：甘藍(lán)型油菜 cor413基因家族 低溫 生物信息學(xué)
摘要：COR413(cold- regulated 413)是植物響應(yīng)低溫與冷害脅迫的重要基因家族,為深入解析油菜耐寒分子機(jī)制,利用生物信息學(xué)方法在甘藍(lán)型油菜、白菜和甘藍(lán)基因組中分別篩選和鑒定到11、6和6個(gè)COR413基因,它們大部分定位在質(zhì)膜和葉綠體膜上。COR413家族蛋白高度保守,具疏水性,較穩(wěn)定,含有COR大家族其它類型蛋白所沒有的色氨酸,不含信號肽。擬南芥、白菜和甘藍(lán)組織表達(dá)特異性分析發(fā)現(xiàn),亞家族I中的基因大部分在根和葉中有較高的表達(dá)量,亞家族II中的基因在莖和葉中有高表達(dá)。
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