巨龍竹肉桂醇脫氫酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析
孫金金; 朱金鑫; 王娟; 楊宇明; 西南林業大學; 云南省林業科學院國家林業局云南珍稀瀕特森林植物繁育和保護重點實驗室; 云南省林業科學院云南省森林培育與開發利用重點實驗室
關鍵詞：肉桂醇脫氫酶 巨龍竹 基因克隆 熒光定量
摘要：肉桂醇脫氫酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木質素生物合成途徑的關鍵酶。研究根據巨龍竹轉錄組數據設計的一對特異引物,運用逆轉錄PCR(RT-PCR)技術從巨龍竹莖稈中克隆得到肉桂醇脫氫酶基因DsCAD,該基因包含1080 bp的完整c DNA開放閱讀框,編碼359個氨基酸,理論相對分子質量38689.6,等電點6.18。利用生物信息學方法對DsCAD進行分析,結果顯示:DsCAD氨基酸序列包含CAD超家族的保守結構域,具有植物CAD基因的典型特征;其與禾本科植物CAD基因的同源性較高,親緣關系較近,其中與孝順竹的同源性高達95%。熒光定量PCR檢測結果顯示DsCAD基因在巨龍竹竹筍中的表達量要高于莖稈,而在莖稈中的表達量有明顯高于葉。
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